Ĉel-penetrantaj peptidoj estas malgrandaj peptidoj kiuj povas facile penetri la ĉelmembranon.Ĉi tiu klaso de molekuloj, precipe CPPoj kun celaj funkcioj, havas promeson por efika droglivero al celĉeloj.
Tial, la esplorado pri ĝi havas certan biomedicinan signifon.En ĉi tiu studo, CPPoj kun malsamaj transmembranaj agadoj estis studitaj ĉe la sinsekvnivelo, provante eltrovi la faktorojn influantajn la transmembranan agadon de CPPoj, la sekvencdiferencojn inter CPPoj kun malsamaj agadoj kaj NonCPPoj, kaj enkonduki metodon por analizi biologiajn sekvencojn.
CPPoj kaj NonCPPs-sekvencoj estis akiritaj de la CPPsite-datumbazo kaj malsamaj literaturoj, kaj transmembranaj peptidoj (HCPPoj, MCPPoj, LCPPoj) kun alta, meza kaj malalta transmembrana agado estis ĉerpitaj de la CPPoj-sekvencoj por konstrui datenojn.Surbaze de ĉi tiuj datumaj aroj, la sekvaj studoj estis faritaj:
1, La aminoacido kaj sekundara strukturo-konsisto de malsamaj aktivaj CPP-oj kaj NonCPP-oj estis analizitaj de ANOVA.Oni trovis, ke la elektrostatikaj kaj hidrofobaj interagoj de aminoacidoj ludis gravan rolon en la transmembrana agado de CPP-oj, kaj la helikforma strukturo kaj hazarda volvaĵo ankaŭ influis la transmembranan agadon de CPP-oj.
2. La fizikaj kaj kemiaj propraĵoj kaj longoj de CPP-oj kun malsamaj agadoj estis montritaj sur la dudimensia ebeno.Estis trovite ke CPPoj kaj NonCPPoj kun malsamaj agadoj povus esti grupigitaj sub kelkaj specialaj trajtoj, kaj HCPPoj, MCPPoj, LCPPoj kaj NonCPPoj estis dividitaj en tri aretojn, montrante siajn diferencojn;
3. En ĉi tiu artikolo, la koncepto de fizika kaj kemia centroido de biologia sekvenco estas enkondukita, kaj la restaĵoj komponantaj la sekvencon estas rigarditaj kiel partiklopunktoj, kaj la sekvenco estas abstraktita kiel partiklosistemo por esplorado.Tiu metodo estis aplikita al la analizo de CPPoj projekciante CPPojn kun malsamaj agadoj sur la 3D-aviadilon per PCA-metodo, kaj estis trovite ke la plej multaj CPPoj amasiĝis kune kaj kelkaj LCPPoj amasiĝis kune kun NonCPPoj.
Ĉi tiu studo havas implicojn por la dezajno de CPPoj kaj komprenado de la diferencoj en la sekvencoj de CPPoj kun malsamaj agadoj.Krome, la analiza metodo de fizika kaj kemia centroido de biologiaj sekvencoj enkondukitaj en ĉi tiu artikolo ankaŭ povas esti uzata por la analizo de aliaj biologiaj problemoj.En la sama tempo, ili povas esti utiligitaj kiel enigparametroj por kelkaj biologiaj klasifikproblemoj kaj ludi rolon en padronrekono.
Afiŝtempo: Jun-15-2023