Peptydy penetrujące komórki to małe peptydy, które mogą łatwo przenikać do błony komórkowej. Ta klasa cząsteczek, zwłaszcza CPP z funkcjami celowania, obiecuje skuteczne dostarczanie leków do komórek docelowych.
Dlatego badania nad tym mają pewne znaczenie biomedyczne. W tym badaniu badano CPP z różnymi aktywami transbłonowymi na poziomie sekwencji, próbując dowiedzieć się, że czynniki wpływające na aktywność transbłonową CPP, różnice sekwencji między CPP z różnymi aktywnością i noncpps oraz wprowadza metodę analizy sekwencji biologicznych.
Sekwencje CPPS i noncpps uzyskano z bazy danych CPPSITE i różnych literatury, a peptydy transbłonowe (HCPPS, MCPPS, LCPPS) z wysoką, średnią i niską aktywnością transbłonową wyodrębniono z sekwencji CPPS w celu konstruowania zestawów danych. Na podstawie tych zestawów danych przeprowadzono następujące badania:
1, skład aminokwasowy i wtórny struktura różnych aktywnych CPP i NonCPP analizowano metodą ANOVA. Stwierdzono, że elektrostatyczne i hydrofobowe interakcje aminokwasów odegrały ważną rolę w aktywności transbłonowej CPPS, a struktura spiralna i losowe zwijanie również wpłynęły na aktywność transbłonową CPP.
2. Właściwości fizyczne i chemiczne i długości CPP o różnych czynnościach pokazano na płaszczyźnie dwuwymiarowej. Stwierdzono, że CPP i NonCPP z różnymi czynnościami mogły być skupione pod niektórymi specjalnymi właściwościami, a HCPP, MCPP, LCPP i NonCPP zostały podzielone na trzy klastry, pokazując ich różnice;
3. W tym artykule wprowadzono koncepcję fizycznego i chemicznego centroidu sekwencji biologicznej, a reszty składające się z sekwencji są uważane za punkty cząstek, a sekwencja jest abstrakcyjna jako układ cząstek do badań. Metodę tę zastosowano do analizy CPPS poprzez wyświetlanie CPP z różnymi czynnościami na płaszczyznę 3D metodą PCA i stwierdzono, że większość CPP skupiła się razem, a niektóre LCPP skupiły się razem z noncpps.
Badanie to ma wpływ na projekt CPP i zrozumienie różnic w sekwencjach CPP o różnych czynnościach. Ponadto do analizy innych problemów biologicznych można również zastosować metodę analizy fizycznego i chemicznego centroidu sekwencji biologicznych wprowadzonych w tym artykule. Jednocześnie można je wykorzystać jako parametry wejściowe dla niektórych problemów z klasyfikacją biologiczną i odgrywać rolę w rozpoznawaniu wzorców.
Czas postu: 2025-07-02